卡尔森管理学院(Carlson School of Management)
卡尔森管理学院的宗旨是推动管理手段在经济全球化中的发展进步，并促进技术革新和社会变革。卡尔森管理学院建立于1919年，是美国最好的商学院之一。2001年， 该学院的MBA专业在全美排名中位居第28位。同时，该学院的信息管理系统和医疗管理专业在全美排名第三和第四名。2001年秋季，卡尔森学院同广州中山大学岭南学院合办的EMBA正式召生，它是经中国教育部批准的第一个由外国大学与中国大学合办的工商管理教学项目。卡尔森管理学院的强项是她周围的生气勃勃的企业社区，学院有一个活跃的监督委员会和由校友以及高级经理组成的校友顾问委员会，学生们可以充分利用这些委员会，使之成为出色的人生实验室。一流的师资队伍加上生机勃勃的企业社区为雄心勃勃的企业领导人提供了深入理解企业，包括未来型企业的理想氛围。高素质的学员和教师以及与企业的接触使它显示出其应有的优势。 卡尔森管理学院继续成为《成功》杂志评选的“企业家首选的25所商学院”。 《电脑世界》中将其技术MBA课程列为全美第4位。 在管理学院刊物的评选中，卡尔森管理学院的师资研究位居全国第7位;其生产管理科学的师资研究更是名列首位。 在2005年度的《美国新闻与世界报道》的评选中，卡尔森管理学院的全职MBA排名第23位，兼职MBA排名第15位， 而EMBA则名列第20位。 此项评选以学校的学术声望，学生成绩以及毕业生的起薪作为标准。CHEMBA是明尼苏达大学卡尔森管理学院提供的高级管理人员MBA(EMBA)课程。卡尔森管理学院的EMBA课程在2005年被《美国新闻与世界报道》评选为全美前21个最佳EMBA课程之一。CHEMBA获得中国教育部和国务院学位委员会批准。成功完成学习的学员将获得由明尼苏达大学授予的工商管理硕士学位(MBA)，该学位得到美国管理教育协会(AACSB)的认可。
人文学院(College of Liberal Arts)
人文学院是明大作为综合性大学的核心，拥有500多名教授和40多个系，为全校提供博雅教育，致力提高教学和研究的广度和深度。人文学院拥有世界一流的专业水平，该学院的经济学、美国研究、政治学、心理学、传播、统计等大部分专业在全美排名前20。人文学院的亚洲语言及文学系同天津南开大学合作的暑期汉语培训班已经成功地举办了21年。
休伯特·汉弗莱公共事务学院(Hubert H. Humphrey School of Public Affairs)
该学院以享有佳誉的前美国副总统休伯特·汉弗莱(Hubert H. Humphrey) 命名，是明大为志在公共事务和策划方面深造的学生设立的专业研究生院。该学院在全美公共政策专业的排名中始终名列前20。同时，该学院也是闻名美国的公共政策问题研究中心。
法学院(Law School)
法学院在全美排名第19位。它的成就，及其独特的历史，位置和人物使法学院在全美赢得佳誉。在司法教育界，明大法学院的教授们的教学和研究能力在美国及国际上都享有很高的声望。
理工学院(College of Science and Engineering)
理工学院拥有教授近400人，13个系以及24个涉及工程、物理科学和数学等方面的研究中心。该学院不仅是全美一流的教育、科研学院，而且是众多闻名世界的科技成果的诞生地, 如铀235的分离、“黑匣子”等。技术学院的教授、学生和校友都对学院“创造明天”的座右铭身体力行;秉承严谨的敬业精神，技术学院在科技领域中的教育，科研和技术转让等方面做出了杰出的贡献。
食品、农业与自然资源科学学院(College of Food, Agricultural and Natural Resource Sciences)
食品、农业与自然资源科学学院的成立可以追溯到1851年，当时明州的立法机构开始实施一项农业教育方案。如今，该学院已成为世界最好的五所农业学院之一。学院设立包括土壤、植物、动物、食品、环境等多项应用科学专业，拥有400多位教授和科研专家，其毕业生在世界各国皆成为农业、食品和环境科学领域的精英。中国植物生理学的奠基人汤佩松教授和被誉为“中国农业之父”的中国农科院院长的金善宝教授都毕业于该学院。
建筑学院(School of Architecture)
明尼苏达大学建筑学院位于双城校区Ralph Rapson Hall内，新楼扩建部分由Steven Holl 设计并于2002年完工。建筑学院下包括建筑学系与建筑景观系，另有建筑保护，城市设计等专业。建筑学院建立于1913年，迄今有一百年的历史，培养了大批建筑师，据统计，明尼苏达州80%以上建筑师毕业于此，拥有巨大的专业影响力和广泛的校友网络。明尼苏达大学建筑学院教学以传统理论教育见长，受欧洲现代建筑理论影响较大，诸多教授师从沙里宁和路易斯·康，并发展出了一套独特的建立在建筑现象学与建筑心理学基础上的建筑认识理论。同时学院近年在新兴建筑材料研究方面也取得了丰硕的成果。学院教学强调优先培养学生明锐的观察能力和设计思考方式以应对瞬息万变的现代建筑设计手段，注重设计方法和建筑设计本质的认识，要求学生善于发现和引用建筑环境中的机遇，通过连续而完整的建筑设计优化自然和社会环境。在传统建筑理论教学方面，Andrzej Piotrowski 教授的建筑理论和William F. Conway教授的城市发展理论均闻名全美。而Lee Anderson 教授的可视化建筑与Marc Swackhamer,Blaine Browenll教授在新兴建筑材料方面的研究成果也令人振奋。这里的建筑学授予建筑学学士学位(未获NAAB认证，4年制)与建筑学硕士学位(已获NAAB认证)。
明大其它院校中心包括：
专职医疗中心(Center for Allied Health Programs)
生物科学学院(College of Biological Sciences)
进修教育学院(College of Continuing Education)
牙医学院(School of Dentistry)
设计学院(College of Design)
教育和人力发展学院(College of Education and Human Development)
推广合作部(Extension)
研究生学院(Graduate School)
医学院(Medical School)
护理学院(School of Nursing)
药学院(College of Pharmacy)
公共卫生学院(School of Public Health)
兽医学院(College of Veterinary Medicine)